O projecto HERMIONE (Hotspot Ecosystem Research and Man's Impact On European Seas) continuou a partir do projecto HERMES e concentrou-se em investigar os ecossistemas submarinos. Um dos principais objetivos do Hermione era contribuir para as políticas ambientais da UE. O projecto decorreu entre Abril de 2009 e Setembro de 2012, e foi apoiado pelo programa FP7.